MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid pSZ4

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020165	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060930
2	NC_020165	TGA	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060930
3	NC_020165	AAG	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060930
4	NC_020165	ATC	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	445060930
5	NC_020165	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	445060930
6	NC_020165	AAT	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060930
7	NC_020165	GTTA	2	8	961	968	25 %	50 %	25 %	0 %	445060930
8	NC_020165	AT	3	6	1008	1013	50 %	50 %	0 %	0 %	445060930
9	NC_020165	AGCA	2	8	1027	1034	50 %	0 %	25 %	25 %	445060930
10	NC_020165	TTTG	2	8	1064	1071	0 %	75 %	25 %	0 %	445060930
11	NC_020165	TTG	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060930
12	NC_020165	GGT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	445060930
13	NC_020165	TTTA	2	8	1115	1122	25 %	75 %	0 %	0 %	445060930
14	NC_020165	A	7	7	1141	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	445060930
15	NC_020165	T	7	7	1157	1163	0 %	100 %	0 %	0 %	445060930
16	NC_020165	AAG	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060931
17	NC_020165	T	6	6	1433	1438	0 %	100 %	0 %	0 %	445060931
18	NC_020165	GTT	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060931
19	NC_020165	AATG	2	8	1522	1529	50 %	25 %	25 %	0 %	445060931
20	NC_020165	AAC	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060931
21	NC_020165	T	7	7	1583	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	445060931
22	NC_020165	A	8	8	1601	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	445060931
23	NC_020165	ATA	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060931
24	NC_020165	AT	4	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	445060931
25	NC_020165	GAA	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
26	NC_020165	TTAC	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	445060932
27	NC_020165	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	445060932
28	NC_020165	ACC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	445060932
29	NC_020165	TTG	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060932
30	NC_020165	TAA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
31	NC_020165	TA	3	6	2508	2513	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
32	NC_020165	TAA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
33	NC_020165	ATG	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
34	NC_020165	GAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
35	NC_020165	AGATT	2	10	2654	2663	40 %	40 %	20 %	0 %	445060932
36	NC_020165	GAA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
37	NC_020165	ATT	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060932
38	NC_020165	GTGATA	2	12	2781	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
39	NC_020165	ATTC	2	8	2794	2801	25 %	50 %	0 %	25 %	445060932
40	NC_020165	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
41	NC_020165	AATT	2	8	2848	2855	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
42	NC_020165	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
43	NC_020165	AT	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
44	NC_020165	A	6	6	2964	2969	100 %	0 %	0 %	0 %	445060932
45	NC_020165	AGCA	2	8	2976	2983	50 %	0 %	25 %	25 %	445060932
46	NC_020165	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
47	NC_020165	TAAATA	2	12	3040	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
48	NC_020165	TTAA	2	8	3059	3066	50 %	50 %	0 %	0 %	445060932
49	NC_020165	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	445060933
50	NC_020165	AGAA	2	8	3207	3214	75 %	0 %	25 %	0 %	445060933
51	NC_020165	AT	3	6	3229	3234	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
52	NC_020165	A	7	7	3235	3241	100 %	0 %	0 %	0 %	445060933
53	NC_020165	TA	3	6	3328	3333	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
54	NC_020165	ATTA	2	8	3366	3373	50 %	50 %	0 %	0 %	445060933
55	NC_020165	GTA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060933
56	NC_020165	TAT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060933
57	NC_020165	TGA	2	6	3780	3785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
58	NC_020165	CGA	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060934
59	NC_020165	TAAG	2	8	4023	4030	50 %	25 %	25 %	0 %	445060934
60	NC_020165	TGA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
61	NC_020165	CAA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060934

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.